De gekozen programma's bepalen hoeveel je zelf nog moet bijsturen. Een basisprogramma mengt, kneedt, laat rijzen en bakt deeg volgens een vast tijdschema. De korstinstelling verandert vooral de baktijd van ieder programma. Kies licht, middel of donker op basis van meelsoort, gewenste korst en persoonlijke voorkeur. Snelle programma's besparen tijd.
Voor volkoren meel en zwaarder deeg is een langer programma nuttig, omdat dit meel meer vocht opneemt en trager rijst. Een glutenvrij programma gebruikt meestal aangepaste kneed- en rijstijden. Dat voorkomt een te droog of ingezakt resultaat.
Voeg noten of zaden pas toe na het signaal, zodat de kneedhaak ze niet fijnmaalt. Met een uitgestelde start kan het deeg later beginnen, zolang bederfelijke ingrediënten zoals verse melk of ei buiten de bakvorm blijven. Wie regelmatig recepten met verschillende meelsoorten bakt, kiest beter een broodmachine met duidelijke programmaomschrijvingen en een handmatige stand, omdat je daarmee rijstijd en kneden kunt aanpassen aan het deeg.