Vacuümfiltratie werkt alleen met een passende gesloten opstelling. Een Büchnertrechter heeft een geperforeerde plaat voor filterpapier. De zuigfles houdt onderdruk vast. Daardoor gaat vloeistof sneller door het filter. Gebruik een adapter tussen trechter en fles, zodat de verbinding niet lekt.
Bevochtig het filterpapier eerst met hetzelfde oplosmiddel, want daardoor sluit het beter aan op de plaat. Te sterke onderdruk kan schuim veroorzaken of een kwetsbaar filter scheuren, vooral bij mengsels met veel fijne vaste deeltjes, een kleine poriegrootte en een relatief trage doorstroming. Zet de vacuümbron pas daarna aan.
Verwarm je oplossing vooraf, kies dan schokbestendig glas en plaats die veilig op een warmhoudplaatje voor laboratoriums. Koelt de vloeistof in de trechter snel af, dan kunnen kristallen ontstaan die de uitloop blokkeren.